質(zhì)譜法可以進(jìn)行有效的定性分析，但對(duì)復(fù)雜有機(jī)化合物的分析就顯得無(wú)能為力；而色譜法對(duì)有機(jī)化合物是一種有效的分離分析方法，特別適合于進(jìn)行有機(jī)化合物的定量分析，但定性分析則比較困難。氣質(zhì)聯(lián)用儀是指將氣相色譜儀和質(zhì)譜儀聯(lián)合起來(lái)使用的儀器,廣泛應(yīng)用于復(fù)雜組分的分離與鑒定，其具有g(shù)c的高分辨率和質(zhì)譜的高靈敏度，是生物樣品中藥物與代謝物定性定量的有效工具。
gc-ms氣質(zhì)聯(lián)用儀總體上由以下部分組成：色譜儀（常壓）、接口部分、質(zhì)譜分析器（高真空）和計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)。
1、氣相色譜儀
主要包括5大系統(tǒng)：氣路系統(tǒng)、進(jìn)樣系統(tǒng)、分離系統(tǒng)、溫度控制系統(tǒng)以及檢測(cè)和記錄系統(tǒng)。
（1）載氣系統(tǒng)：包括氣源、氣體凈化、氣體流速控制和測(cè)量。為獲得純凈、流速穩(wěn)定的載氣。
（2）進(jìn)樣系統(tǒng)：包括進(jìn)樣器和氣化室。進(jìn)樣器分氣體進(jìn)樣器和液體進(jìn)樣器，氣化室是將液體樣品瞬間氣化的裝置。
（3）分離系統(tǒng)：包括色譜柱和柱溫箱和控溫裝置。根據(jù)各組分在流動(dòng)相和固定相中分配系數(shù)或吸附系數(shù)的差異，使各組分在色譜柱中得到分離。
（4）溫控系統(tǒng)：控制氣化室、柱箱和檢測(cè)器的溫度。
（5）檢測(cè)和記錄系統(tǒng)：包括檢測(cè)器、放大器、記錄儀、或數(shù)據(jù)處理裝置、工作站（色譜圖）。將各組分的濃度或質(zhì)量轉(zhuǎn)變成電信號(hào)并記錄。
2、接口部分
接口：由gc出來(lái)的樣品通過(guò)接口進(jìn)入到質(zhì)譜儀，接口是色質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)的關(guān)鍵。一般分為直接接口（小口徑毛細(xì)管柱）和開(kāi)口分流接口（大口徑毛細(xì)管柱），用于除去gc部分的載氣并傳輸組分。在gc-ms聯(lián)用中有兩個(gè)作用：
（1）壓力匹配——質(zhì)譜離子源的真空度在10-3pa，而gc色譜柱出口壓力高達(dá)105pa，接口的作用就是要使兩者壓力匹配。
（2）組分濃縮——從gc色譜柱流出的氣體中有大量載氣，接口的作用是排除載氣，使被測(cè)物濃縮后進(jìn)入離子源。
3、ms質(zhì)譜部分
質(zhì)譜儀的基本部件有：離子源、濾質(zhì)器、檢測(cè)器三部分組成。
（1）離子源：離子源的作用是接受樣品產(chǎn)生離子。常用的離子化方式有：電子轟擊ei;化學(xué)電離ci。
（2）質(zhì)量分析器：其作用是將電離室中生成的離子按質(zhì)荷比（m/z）大小分開(kāi)，進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)。常見(jiàn)質(zhì)量分析器有：四極質(zhì)量分析器;扇形質(zhì)量分析器;雙聚焦質(zhì)量分析器;離子阱檢測(cè)器。
（3）檢測(cè)器：檢測(cè)器的作用是將離子束轉(zhuǎn)變成電信號(hào)，并將信號(hào)放大，常用檢測(cè)器是電子倍增器。